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2019-09-30

【钻石生技投资分析室】专家观点/善用基因编辑 揪出实验盲点

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發布日期:2019-09-30

原始連結:https://www.diamondbiofund.com/tc/news_detail38_1.htm


2019-09-30 00:24经济日报 杨奇凡

本(9)月12日,美国冷泉港实验室的Jason Sheltzer教授以CRISPR-Cas9基因编辑技术证实,六个广为人知的肿瘤治疗靶点竟然是错的。讽刺的是,目前已知有十个药物,其中七个在临床阶段,正根据错误的靶点与机制进行开发,牵连29项临床试验与上千位受试者。消息一出震惊全球。

六个有问题的靶点分别为CASP3、HDAC6、MAPK14、PAK4、PBK以及PIM1。十种药物分别为针对CASP3的1541B与PAC-1、针对HDAC6的Citarinostat与Ricolinostat、针对MAPK14的Ralimetinib与SCIO-469、针对PAK4的PF-03758309、针对PBK的OTS514与OTS964,以及针对PIM1的SGI-1776。其中不乏国际知名大厂如辉瑞(Pfizer)与今年初已被BMS併购的旗下产品的赛基(Celgene),产品开发前景蒙尘。

两年前基因编辑技术兴起后,Sheltzer开始尝试将CRISPR技术应于肿瘤治疗,选定了经全球多个实验室与数十篇重要论文验证,对癌细胞生长至关重要的靶点MELK(maternal embryonic leucine zipper kinase)进行实验。但当Sheltzer以CRISPR将MELK基因剔除后却发现,没有MELK基因竟也不影响癌细胞生长。此外,在没有MELK基因的存在下,OTS167药物(临床二期试验中的MELK抑制剂)却仍能有效抑制癌细胞生长。换句话说,OTS167的抗癌机制与MELK无关,而是因“脱靶效应”影响了其他机制,此重大成果发表于2017年的《eLife》杂誌。

Sheltzer曾表示,错误的根源可能是研究方法所造成,临床试验中的许多靶点,往往是由五到十年前的旧技术所发现。当时为确认靶点,学界常使用一种名为RNAi的技术,认为此技术能达到专一性的靶点基因抑制。然而实验却证实,早期未成熟的RNAi技术常发生脱靶效应,除抑制目标基因外,也会影响其他序列相近的基因。因此,使用相对精准的CRISPR技术剔除靶点基因时,问题才会浮现。

意识到问题的严重性,Sheltzer决定对更多具类似背景的临床药物进行测试。本次公布的六个肿瘤靶点在经过CRISPR技术逐一验证后,同样被证实并非治疗靶点。Sheltzer更以可行的实验设计,成功找出部分药物的真实靶点,例如原来被认为是抑制PBK的药物-OTS 964,Sheltzer找出此药真正的功能性靶点是与细胞生长分化相关的CDK11蛋白。然而,科学界至今对CDK11蛋白所知仍十分有限。

任职于丹娜.法伯癌症研究所的美国国家科学院院士William Kaelin教授在接受《Science》采访时表示,Sheltzer的研究解释了许多抗癌药物在临床试验中失败的原因,为药物研发工作者提供了极为重要的信息。MD Anderson癌症中心的Traver Hart教授认为,应尽快将早期RNAi技术所发现的“假靶点”从药物研发管线中清除。此外,鑑于CRISPR本身也会发生脱靶效应,因此应透过其他技术反覆验证靶点的正确性。

靶点选择是抗癌药物开发的关键,错误的靶点认知下,适应症的选择与临床试验方向可能全错。政府的法规评价单位却可能因此误判药物的毒性风险与副作用。随时间累积,更可能致使全球的研发资源投入错误方向。

根据《JAMA Internal Medicine》于2017年所公布的研发经费统计,一个癌症新药的开发,平均耗时上看15年,耗资达6.48亿美元。根据2018年《Biostatistics》的文献统计,癌症药物的开发成功率只有3.4%,因此各大药厂无不如履薄冰。

Sheltzer的研究证明,面对新靶点时更须谨慎,因为即使是经过国际一流指标实验室反覆验证后的靶点,也可能是错的。

一个正确的新靶点,带动的可能是年销数百亿美元的药物,例如PD1药物,但错了也可能让整批药物陪葬。观察国际交易案不难发现,机制愈清楚,可预测性愈高的药物,大药厂购买意愿也愈高,原因就在风险。资本雄厚的大药厂尚且如此,中小资本的台湾药企更应尽力将成功率极大化,风险极小化。在保留弹性与创意的同时,更应对任何证据抱持疑问、谨慎面对,想得更多才能走得更远。(作者是钻石生技投资研究室研究员)

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