海洋大学、基龙米克斯生技联手破解台湾樱花钩吻鲑基因密码
發布日期:2013-11-15
原始連結:https://www.diamondbiofund.com/tc/news_detail283_1.htm
【中央社讯息服务】
国立台湾海洋大学与基龙米克斯生物科技公司今(15)日发表国宝鱼“台湾鲑鱼(樱花钩吻鲑)基因解码计画”初步研究成果,张清风校长表示,这是国内首度针对台湾特有种生物进行全基因体的解码工程,将对台湾鲑的繁殖復育、物种保育、环境适应(陆封洄游)等问题皆能有重大的贡献,啟动台湾生态保育工作迈向一个崭新的里程碑。
海洋大学表示,台湾鲑鱼是一种生活在七家湾溪上游的特殊陆封型鲑鱼,在生物学上有其独特的重要性,由于牠的稀有与濒临绝种,长期以来受到社会各界关注,同时也投入相当多的人力与研究资源,尤其过去海洋大学在台湾鲑鱼的栖地保护及人工復育工作上的努力,奠定了推动保育工作之基础,也见到了不错的成果。目前台湾鲑鱼的族群数量从1992年数量最低的200多尾,逐渐恢復稳定,近5年平均已经有2000尾左右或以上的数量,栖地也从原来的七家湾溪5公里长的河段,逐渐遍及整个七家湾溪及高山溪,透过野外人工放流,近几年在罗叶尾溪、司界兰溪支流也都有出现台湾鲑鱼族群的踪迹。
海大校长张清风指出,台湾鲑鱼是唯一生存在亚热带地区的鲑鱼,原有溯河产卵及降海生息的习性,在气候寒冷的更新世冰河时期拓殖到中台湾溪流。而后受到冰河时期与地质变动的交互作用,使得洄游路径被阻隔在台湾中部的大甲溪,演化成为陆封型的鲑鱼,是冰河时期的孑遗物种,在生物地理研究史上具有划时代的意义,在国内外的保育生物研究中,一直受到相当的关注。 张校长说,台湾鲑鱼不仅是生物演化的重要题材,也是环境指标物种,不论在自然歷史、学术研究、生态保育与环境教育等领域皆具有极高的价值与指标意义。目前全球各国都对重要的生物的资源进行不同方式的保育工作,透过基因体解码获取物种特性与保育工作所需的信息已经成为主要方式之一,例如义大利与法国一起完成松露的基因图谱解码,中国大陆对熊猫等物种积极的进行大量生物基因体解码工作等。因为各国都知道,基因图谱的解读,开创了保育濒临绝种生物或经济生物资源利用的新道路。到目前为止,全球大力推动重要鱼类的基因体解码已有11种鱼类完成或接近完成,而生物资源丰富的宝岛台湾在这种要的关键时刻也不能缺席。
这次海洋大学与基龙米克斯生技公司及神通资科携手合作,将保育的工作再度提升到基因体解码的层级,同时获得富邦金融控股公司、台新金融控股公司及钻石生技投资股份有限公司的大力支持,在农委会及雪霸国家公园管理处的协助下,希望进一步藉由基因体解码得到更多延续其族群的宝贵资料。由于目前尚无明确的台湾鲑鱼基因体大小的相关研究,因此按照最相近的大西洋鲑鱼来估计台湾鲑鱼的单倍体基因体应落在3000Mb上下,基龙米克斯董事长游卓远推估其功能性基因约有3万个左右。
透过海洋大学及基龙米克斯研究团队经过两年多的努力,目前台湾鲑鱼全基因体定序解码工程已经完成gDNA总定序量达400G,可以涵盖80%以上的全基因体覆盖度(约2.2G),预计今年底可以达成600G的gDNA总定序量,全基因体覆盖度可达85%(约2.2G)。
未来除了持续完成台湾鲑鱼全基因体解码之外,研究团队将透过其他物种已知基因来协助,找出台湾鲑鱼的性别分化和环境适应相关的功能性基因,建立基因资料库,了解牠在环境适应能力、演化、生殖调控及各种性状等与基因的关係,同时透过亲缘关係的比对,避免近缘交配,进一步增进族群的健康。甚至透过降海(适应海水)的机制,可能可以促进台湾鲑鱼体型的增大、产卵数目的增加与卵质的提高,产生更多优良的后代。
讯息来源:国立台湾海洋大学